Мне необходимо сделать кнопку.
При клике на которую всплывет окно с вопросом. Хочу ли я выполнить данное действие?

Допустим я хочу удалить пользователя. 
Если я нажму на кнопку, всплывет вопрос. Если нажму да, то пользователь удалится. Если нет, то не удалится и форма с вопросом закроется.
Подскажите как это сделать?

Можно попробовать воспользоваться функцией confirm.
С помощью данной функции можно вызвать модальное окно с текстом вопроса и кнопками "Ок" и "Отмена".
Пример кода:

if (confirm('Вы действительно хотите удалить пользователя?') {
    // При клике на кнопку "Ок" мы попадем сюда
}

Есть еще jquery либа с приятным отображением окна с подтверждением действий.
https://github.com/craftpip/jquery-confirm